Tasa-arvoasiain neuvottelukunta voi perustaa jaostoja ja erilaisia työryhmiä. Nykyinen neuvottelukunta on perustanut Sukupuoli ja valta -jaoston sekä Miesjaoston.
Molemmat jaostot toimivat neuvottelukunnan asiantuntijaeliminä omilla aloillaan. Lisäksi niiden rooliin kuuluu toimia keskustelun herättäjinä ja aloitteentekijöinä.